微流控芯片虽然被冠以芯片之名，但其与传统的集成电路芯片相比，又有其区别和特点。 其早期是微系统通过微加工工艺，在不同材料的基片上加工出微米至亚毫米级的各种微结构单元，而后在微米尺度空间对流体进行操控，可以配合流体控制或分析仪器自动完成生物实验室中的提取、扩增、萃取、标记、分离、分析，或者细胞的培养、处理、分选、裂解、分离分析等过程。
与其他集成电路芯片相比，微流控芯片有两类芯片，一类是传统的，使用机密机加工、微注塑等手段制备的塑料片，这一类还是依赖外接各种供液管路、检测模块等外接辅助设备，并不是真的意义上的芯片；另外一类是硅基的，主要使用微纳加工工艺制备的集成了处理电路、液体驱动微系统结构、液相检测电极等一系列执行器和传感器的微流控芯片，摆脱外接辅助设备的限制，实现了片上集成微流控系统的功能。
从技术上看，传统芯片主要是利用电学系统来实现控制，而微流控芯片还包含了电学、流体、传感等一系列模块。它的微系统通常是用来处理液体的。具体来讲，就是在半导体上形成微流控，或者液体流通的一些微小通道，同时这个微通道要与微系统结构的可控电路紧密结合。简单来讲，微流控芯片是基于传统的集成电路芯片，又做了一些适用于液体处理的微系统。
微流控芯片是基于应用工艺的定制型特殊流道结构部件，其通道结构和尺寸均与项目工艺需求相结合，属定制型结构件。
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